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Hachiman V2 deprioritized

Hachiman

Système à 2 composants (HamA hélicase + HamB nucléase) qui détecte l'infection et dégrade l'ADN phagique. Présent dans ~3 % des génomes bactériens. Spectre d'activité anti-phage particulièrement large dans l'atlas Bernheim 2026.

Note · The source descriptive content (description, princeps citation, v1_opportunity) is curated in French and shown here as-is for accuracy. Side-by-side English translation requires sourced re-curation per family — open via PR if you want to contribute.

Origin story

Story of the discovery. Source content in French.

Le système qui tient bon contre presque tous les phages

characterized in 2018 · Doron, Melamed, Ofir et al. (Weizmann Institute) — caractérisation Picton et al. 2024 (Nat. Microbiol.)

Hachiman était un dieu shintô japonais de la guerre et protecteur des samouraïs — une figure de défense large-spectre. Le système anti-phage qui porte son nom mérite la comparaison : il défend contre une diversité exceptionnelle de phages, à travers plusieurs familles taxonomiques. Son architecture est minimaliste — juste deux protéines, HamA (une hélicase ATPase) et HamB (une nucléase) — mais cette simplicité cache une question fascinante : qu'est-ce que HamA reconnaît qui est conservé chez tant de phages différents ? Probablement un motif universel du cycle de réplication phagique, peut-être un intermédiaire de réplication ou une structure secondaire d'ADN spécifique de la phase lytique.

Why we care · L'architecture « surveillance ATPase + effecteur conditionnel » de Hachiman a un parallèle direct avec RIG-I / MDA5 humains (les senseurs hélicase d'ARN viral qui activent l'interféron type I). Comprendre comment HamA reconnaît un motif phagique conservé éclairerait la conception de modulateurs RIG-I/MDA5 pour potentialiser l'immunité antivirale innée.

V1 strategy

Therapeutic modality retained

Modèle d'étude de la surveillance ATPase antivirale

In silico opportunity at 12 months

Spectre anti-phage particulièrement large suggérant la reconnaissance d'un motif phagique conservé — analogie avec la reconnaissance par RIG-I/MDA5 de motifs viraux universels. Cf. hypothèse Bactaegion `hachiman-hama-hamb-innate-sensing`.

Molecular architecture

Sensor domains

— not documented in V1 —

Effector domains

Proteins

0 protein associated. Names and organisms fetched live from UniProt.

No protein annotated for this system in V1.

Literature

Recent publications (≥2018) mentioning this family. OpenAlex index, CC0 metadata, fetched live by your browser.

Curation

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