Ssp · DNA phosphorothioate restriction
Système de restriction basé sur la modification phosphorothioate (PT) de l'ADN. SspE est un effecteur GTPase qui reconnaît un motif 5'-CPSCA-3' modifié par PT, hydrolyse le GTP, et active sa nuclease HNH C-terminale pour cliver l'ADN phagique non-modifié. Mécanisme « recognize-hydrolyze-activate » avec interrupteur allostérique GTP.
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Story of the discovery. Source content in French.
Le système qui change le squelette de son propre ADN pour ne pas se confondre avec l'ennemi
characterized in 2007 · Wang, Chen, Yang, Wei, Bao et al. (Shanghai Jiao Tong) — paper cryo-EM 2026 par Zhou et al. (mBio)
Imagine que tu veuilles distinguer ton propre courrier de celui des spammeurs. Une bactérie a trouvé une solution radicale : modifier chimiquement la totalité de son propre ADN avec des groupes phosphorothioate (PT) — un atome de soufre à la place d'un oxygène dans la liaison phosphate. Ses propres protéines de défense (SspB, SspC, SspD) installent cette signature ; et SspE, l'effecteur GTPase à HNH nuclease, clive tout ADN qui ne porte PAS cette signature. Donc l'ADN phagique entrant, non-modifié, se fait découper. C'est de l'immunité par épigénétique — la bactérie marque le « soi » au sens chimique, et l'effecteur cible le « non-soi » par défaut. Une élégance algorithmique remarquable.
Why we care · Pas d'orthologue humain direct, mais le paradigme « recognize-hydrolyze-activate » est transférable à d'autres GTPases régulées allostériquement (dynamines, septines). C'est aussi un magnifique outil de biologie synthétique : on peut ingénierer des bactéries à immunité PT-dépendante personnalisée.
Therapeutic modality retained
Outil de recherche · ingénierie de résistance phage
In silico opportunity at 12 months
Découvert via run live biblio 2026-05-16. Pas de cible humaine directe identifiée. Intéressant pour le 'recognize-hydrolyze-activate' paradigm, transposable conceptuellement à d'autres GTPases régulées allostériquement.
Sensor domains
- SspE_PT_recognition pfam:PF18816
Effector domains
- SspE_GTPase pfam:PF18816
- HNH_nuclease pfam:PF01844
0 protein associated. Names and organisms fetched live from UniProt.
No protein annotated for this system in V1.
Recent publications (≥2018) mentioning this family. OpenAlex index, CC0 metadata, fetched live by your browser.
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