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Ssp V2 deprioritized

Ssp · DNA phosphorothioate restriction

Système de restriction basé sur la modification phosphorothioate (PT) de l'ADN. SspE est un effecteur GTPase qui reconnaît un motif 5'-CPSCA-3' modifié par PT, hydrolyse le GTP, et active sa nuclease HNH C-terminale pour cliver l'ADN phagique non-modifié. Mécanisme « recognize-hydrolyze-activate » avec interrupteur allostérique GTP.

Note · The source descriptive content (description, princeps citation, v1_opportunity) is curated in French and shown here as-is for accuracy. Side-by-side English translation requires sourced re-curation per family — open via PR if you want to contribute.

Origin story

Story of the discovery. Source content in French.

Le système qui change le squelette de son propre ADN pour ne pas se confondre avec l'ennemi

characterized in 2007 · Wang, Chen, Yang, Wei, Bao et al. (Shanghai Jiao Tong) — paper cryo-EM 2026 par Zhou et al. (mBio)

Imagine que tu veuilles distinguer ton propre courrier de celui des spammeurs. Une bactérie a trouvé une solution radicale : modifier chimiquement la totalité de son propre ADN avec des groupes phosphorothioate (PT) — un atome de soufre à la place d'un oxygène dans la liaison phosphate. Ses propres protéines de défense (SspB, SspC, SspD) installent cette signature ; et SspE, l'effecteur GTPase à HNH nuclease, clive tout ADN qui ne porte PAS cette signature. Donc l'ADN phagique entrant, non-modifié, se fait découper. C'est de l'immunité par épigénétique — la bactérie marque le « soi » au sens chimique, et l'effecteur cible le « non-soi » par défaut. Une élégance algorithmique remarquable.

Why we care · Pas d'orthologue humain direct, mais le paradigme « recognize-hydrolyze-activate » est transférable à d'autres GTPases régulées allostériquement (dynamines, septines). C'est aussi un magnifique outil de biologie synthétique : on peut ingénierer des bactéries à immunité PT-dépendante personnalisée.

V1 strategy

Therapeutic modality retained

Outil de recherche · ingénierie de résistance phage

In silico opportunity at 12 months

Découvert via run live biblio 2026-05-16. Pas de cible humaine directe identifiée. Intéressant pour le 'recognize-hydrolyze-activate' paradigm, transposable conceptuellement à d'autres GTPases régulées allostériquement.

Molecular architecture

Sensor domains

Effector domains

Proteins

0 protein associated. Names and organisms fetched live from UniProt.

No protein annotated for this system in V1.

Literature

Recent publications (≥2018) mentioning this family. OpenAlex index, CC0 metadata, fetched live by your browser.

Curation

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