Viperines bactériennes
Famille des viperines procaryotes. Une enzyme Radical-SAM convertit les nucléotides standards (CTP, UTP, GTP) en dérivés modifiés (ddhNTP) qui agissent comme terminateurs de chaîne contre l'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) des virus. La translation thérapeutique la plus immédiate de l'arsenal bactérien.
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Story of the discovery. Source content in French.
Le système qui copie les recettes humaines, en plus simple
characterized in 2021 · Bernheim, Millman, Sorek, Pinilla-Redondo et al. (Weizmann + INSERM + Copenhagen)
Pendant deux décennies, RSAD2 (« Viperin ») était un mystère vénéré chez les immunologues humains : un gène induit par l'interféron qui freine HIV, HCV, flavivirus, et même quelques coronavirus, mais dont on ne comprenait pas le mécanisme. Puis Aude Bernheim a regardé chez les bactéries. En 2021, son équipe a montré que des centaines de bactéries hébergent un homologue qui fait exactement la même chose contre les phages : produire des nucléotides terminateurs de chaîne (ddhCTP / ddhGTP). Une fois identifié chez la bactérie, le mécanisme est devenu évident chez l'humain — et la bactérie a fourni un modèle structural plus simple à cristalliser pour optimiser les molécules.
Why we care · ddhCTP est un antiviral naturel à large spectre. Stabilisé chimiquement (résistant aux phosphatases qui le dégradent normalement en quelques minutes dans le plasma), c'est un médicament potentiel. Et la version bactérienne reste le meilleur template structural pour le design.
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Therapeutic modality retained
Analogues nucléotidiques (small molecules)
In silico opportunity at 12 months
Énumérer des dérivés ddhNTP, docking/MD sur RdRp de flavivirus, coronavirus, orthomyxovirus et virus vétérinaires. Hit list de 20-30 analogues synthétiquement plausibles.
Sensor domains
— not documented in V1 —
Effector domains
- Radical_SAM pfam:PF04055
12 proteins associated. Names and organisms fetched live from UniProt.
Recent publications (≥2018) mentioning this family. OpenAlex index, CC0 metadata, fetched live by your browser.
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