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CABINET V4 · 1-21

Cette famille a un dossier dans le cabinet de la nouvelle expérience. La fiche V1 (cette page) reste la source longue ; le dossier v4 est plus visuel et orienté parcours.

Voir le dossier v4 →
Viperin retenu V1

Viperines bactériennes

Famille des viperines procaryotes. Une enzyme Radical-SAM convertit les nucléotides standards (CTP, UTP, GTP) en dérivés modifiés (ddhNTP) qui agissent comme terminateurs de chaîne contre l'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) des virus. La translation thérapeutique la plus immédiate de l'arsenal bactérien.

Origin story

Histoire de la découverte, ton vulgarisation. Voir aussi le petit lexique illustré.

Le système qui copie les recettes humaines, en plus simple

caractérisé en 2021 · Bernheim, Millman, Sorek, Pinilla-Redondo et al. (Weizmann + INSERM + Copenhagen)

Pendant deux décennies, RSAD2 (« Viperin ») était un mystère vénéré chez les immunologues humains : un gène induit par l'interféron qui freine HIV, HCV, flavivirus, et même quelques coronavirus, mais dont on ne comprenait pas le mécanisme. Puis Aude Bernheim a regardé chez les bactéries. En 2021, son équipe a montré que des centaines de bactéries hébergent un homologue qui fait exactement la même chose contre les phages : produire des nucléotides terminateurs de chaîne (ddhCTP / ddhGTP). Une fois identifié chez la bactérie, le mécanisme est devenu évident chez l'humain — et la bactérie a fourni un modèle structural plus simple à cristalliser pour optimiser les molécules.

Pourquoi ça nous intéresse · ddhCTP est un antiviral naturel à large spectre. Stabilisé chimiquement (résistant aux phosphatases qui le dégradent normalement en quelques minutes dans le plasma), c'est un médicament potentiel. Et la version bactérienne reste le meilleur template structural pour le design.

Encyclopédie

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Stratégie V1

Modalité thérapeutique retenue

Analogues nucléotidiques (small molecules)

Opportunité in silico à 12 mois

Énumérer des dérivés ddhNTP, docking/MD sur RdRp de flavivirus, coronavirus, orthomyxovirus et virus vétérinaires. Hit list de 20-30 analogues synthétiquement plausibles.

Architecture moléculaire

Domaines senseurs

— non documentés en V1 —

Domaines effecteurs

Protéines

12 protéines associées dans Bactaegion. Noms et organismes fetchés en live depuis UniProt.

Littérature

Publications récentes (≥2018) mentionnant cette famille. Index OpenAlex, métadonnées CC0, fetché en live par votre navigateur.

Curation

Vos notes de lecture, signalements d'imprécision et suggestions d'enrichissement. Stockage IndexedDB local, export JSON pour soumettre en PR. Geste h du rapport engagement.

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