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Bactaegion
cabinet / série 2026/2 / 1-21 · Viperines
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Sources canoniques

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Domaines protéiques
📚 Bibliographie de référence
Bernheim A. et al., Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules, Nature 589 (2021). doi:10.1038/s41586-020-2762-2
Lachowicz J.C. et al., Discovery of a homologous family of antiviral nucleotide analogs, ACS Cent. Sci. 8 (2022).
★ Publication princeps
Bernheim et al. (2021). Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules. Nature.

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1-21 · canonique · série 2026/2

Viperines

Bacterial viperin — antiviral nucleotide analogs

Le système qui copie les recettes humaines, en plus simple

Viperin bactérienne (bVip) convertit CTP/UTP/GTP en analogues ddh-NTP, terminateurs de chaîne contre l'ARN polymérase virale. Même chimie que Sofosbuvir (anti-VHC Gilead, ~30 Md$ de ventes). Précurseur évolutif naturel d'un blockbuster pharmaceutique majeur.

Protéines
12
Hôte
bactéries
Découverte
Bernheim A., 2021
Mécanisme
enzyme radical-SAM → ddh-NTP
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✦ Le récit

Pendant deux décennies, RSAD2 (« Viperin ») était un mystère vénéré chez les immunologues humains : un gène induit par l'interféron qui freine HIV, HCV, flavivirus, et même quelques coronavirus, mais dont on ne comprenait pas le mécanisme. Puis Aude Bernheim a regardé chez les bactéries. En 2021, son équipe a montré que des centaines de bactéries hébergent un homologue qui fait exactement la même chose contre les phages : produire des nucléotides terminateurs de chaîne (ddhCTP / ddhGTP). Une fois identifié chez la bactérie, le mécanisme est devenu évident chez l'humain — et la bactérie a fourni un modèle structural plus simple à cristalliser pour optimiser les molécules.

Découvert en 2021
Par Bernheim, Millman, Sorek, Pinilla-Redondo et al. (Weizmann + INSERM + Copenhagen)
★ Pourquoi on s'en soucie

ddhCTP est un antiviral naturel à large spectre. Stabilisé chimiquement (résistant aux phosphatases qui le dégradent normalement en quelques minutes dans le plasma), c'est un médicament potentiel. Et la version bactérienne reste le meilleur template structural pour le design.

◇ Le détail qui marque

Le nom « viperin » a été inventé en 1995 comme acronyme de virus inhibitory protein, endoplasmic reticulum-associated, interferon-inducible — soit cinq adjectifs entassés. La version bactérienne a perdu le « endoplasmic reticulum » (les bactéries n'en ont pas) mais a gardé tout le reste. La science est rarement aussi efficace dans son vocabulaire.

Structure 3D · AlphaFold
bVip (Viperin Rhodococcus) · A0A1H6JLW8
ouvrir sur alphafold.ebi.ac.uk ↗fiche UniProt ↗
Modèle fetché en direct depuis AlphaFold-EBI · CC BY 4.0 · structure jamais stockée par Bactaegion
↗ Lecture croisée — Wikipédia
CC BY-SA · fetch live, jamais stocké par Bactaegion

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Sources
  1. Bernheim A. et al., Prokaryotic viperins produce diverse antiviral molecules, Nature 589 (2021). doi:10.1038/s41586-020-2762-2
  2. Lachowicz J.C. et al., Discovery of a homologous family of antiviral nucleotide analogs, ACS Cent. Sci. 8 (2022).
Pistes ouvertes sur Viperines · 2
Analogues ddhCTP optimisés pour flavivirus (Zika, dengue)
pré-clinique 7 contrib.
bVip-RSAD2 chimère → activation interféron-indépendante
en cours 4 contrib.