Bactaegion est une démo de ce que l'IA bien employée peut produire en open science.

Cette plateforme a été prototypée en quelques semaines avec Claude (Anthropic) comme partenaire de code, sur un cas réel : l'atlas de défenses bactériennes que l'Institut Pasteur a publié en mai 2026. Le résultat n'est pas un produit fini, c'est un prototype — voir la roadmap publique pour l'état exact de chaque brique.

Peut-on, en 2026, monter une plateforme d'open science crédible en quelques semaines plutôt qu'en plusieurs années ?

Avec un LLM de qualité comme co-pilote (lecture de spec, génération de code, audit critique, design propositionnel, refactor, tests par sub-agents), la réponse est oui — à condition de garder un humain rigoureux en pilotage produit pour : valider les choix scientifiques, recadrer dès que la machine fabrique du wishful thinking, exiger l'honnêteté sur les promesses non livrées.

• Lecture et synthèse des deux rapports préliminaires Gemini (architecture TAZ + audit translationnel).
• Implémentation Astro 5 + React 19 + TypeScript strict (tous les composants v4).
• Refonte itérative des écrans en réponse aux critiques produit (cinematic, triptyque, gestes, dossiers).
• Génération du contenu scientifique calibré (12 scénarios piano-roll, 6 protéines annotation, hypothèses peer-review) à partir de sources publiques nommées (Bernheim 2026, Doron 2018, etc.).
• Audit critique permanent — sub-agents qui testent les parcours et flaggent les régressions.

• Vision produit : à quoi sert Bactaegion, pour qui, contre quoi (cf. /mission/).
• Cadrage scientifique : choix des cibles thérapeutiques prioritaires, distinction entre vrai pipeline réaliste et fantasme (CRISPR-Cas thérapeutique = exclu, Viperines + CBASS + Pycsar + Schlafen + RADAR + Thoeris = retenus).
• Game design : refus des dark patterns (XP, classement, loot box, push), choix du sens épique permanent à la place.
• Veille honnêteté : exiger que tout ce qui est dit sur le site corresponde exactement à ce qui est livré. Pas de Open Badges / DID / ORCID / Yjs annoncés comme imminents s'ils ne sont pas en code (cf. /roadmap/).
• Stratégie translationnelle : identification des relais nécessaires hors Bactaegion (DNDi, GARDP, M4K Pharma) pour amener un hit en clinique.

On pourrait taire l'usage massif de l'IA dans la construction de Bactaegion et passer pour une équipe humaine plus large qu'elle ne l'est. On choisit l'inverse : déclarer ouvertement le mode de production. Si la plateforme tient debout scientifiquement et fonctionne comme prototype d'open science, alors elle prouve quelque chose d'utile sur ce qu'on peut faire en 2026 avec l'IA bien employée. C'est sa raison d'être méta.