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Atelier

Touchez la matière.

Wikipedia donne envie de se balader d'article en article. Foldit a montré qu'un puzzle bien dessiné met un gosse à battre un algorithme. L'Atelier de Bactaegion réunit les gestes par lesquels la communauté touche aux protéines de défense : drag, lasso, swipe, curseur. Pas de tutoriel bloquant — vous saurez ce que c'était après avoir fait le geste.

Commencer ici

Trente secondes pour le premier aha.

Choisissez une protéine ci-dessous, glissez les curseurs, isolez un segment qui vous semble cohérent. Vous venez d'esquisser un domaine — la même opération qui sert de base à l'entraînement des modèles de structure protéique. Aucune biologie requise : votre œil détecte les motifs chromatiques avant que votre intellect ne sache les nommer.

Catalogue des gestes

Huit façons de manipuler le vivant.

Chaque geste a son précédent vérifié dans la littérature des scientific discovery games. Le geste b est livré ; les autres sont en cours d'instrumentation.

b.
disponible

Annotation des frontières de domaines

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Réglez deux curseurs sur une séquence horizontale pour isoler un domaine candidat. Drag-and-drop simple, retour visuel instantané, stockage IndexedDB local. La mécanique-MVP du rapport engagement Gemini.

g.
disponible

Repérage d'opérons atypiques (Piano-roll défilant)

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Un opéron de défense caractérisé descend lentement comme une partition perforée. Les gènes connus brillent en vert/ambre selon le brin. Cliquez sur un « vide candidat » (ORF non annoté, fragment phagique adjacent) pour le signaler localement. Stockage CRDT Yjs local (D5.1 livré). Import live Defense Finder à venir.

c.
disponible

Correction d'alignement BLAST low-confidence

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Deux rubans de séquences que BLAST a mal accrochés. Survolez une position, insérez ou retirez un gap. Score d'identité temps-réel, colonnes match en vert défense, mismatches en rouille. V1 = 2 paires pré-cuites (RdrB↔ADAR1, Cap4↔RNase H1). Import BLAST live + matrice BLOSUM62 à venir.

a.
disponible · V1 simplifié

Clustering structurel de poches de liaison

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Trois cibles V1 (Cap4 CBASS, PycTIR Pycsar, RdrB RADAR). Mol* viewer en lecture, vous déclarez les résidus que vous suspectez de former une poche druggable, les stats simples (taille, hydrophobicité moyenne, charge nette, distribution AA) tombent en temps réel. Pinceau Mol* interactif + FPocket WASM + volume cavitaire calculé à venir.

f.
disponible · V1 simplifié

Superposition spatiale orthologue bactérien-humain

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Trois paires bactérien-humain caractérisées 2020-2024 (RdrB↔ADAR1, Cap4↔RNase H1, Viperine↔RSAD2). Mol* affiche les deux structures côte à côte, RMSD pré-calculé cité depuis littérature, hypothèse de transfert pharmacologique explicitée. Verdict triplé (accepte / récuse / indécis) + note libre signée DID. Manipulation 6DoF interactive avec détection clashes temps-réel à venir.

d.
disponible

Idéation de mécanisme via LLM (BYOK)

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Branchez votre clé Claude, Gemini ou Ollama local. Quatre prompts pré-écrits (3 mécanismes d'inhibition, falsifiabilité, orthologue humain, résumé de papier). Le navigateur appelle directement le moteur — Bactaegion ne voit ni la clé ni la réponse. Conversion réponse → draft MDX CC0 signé DID (D3.6 livré). Streaming + mind-map graphique à venir.

e.
disponible

Évaluation asynchrone par les pairs

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Sur chaque page piste, un panel de peer-review avec 4 jauges (reproductibilité, parcimonie, rigueur biophysique, faisabilité in silico), commentaire libre, verdict trois temps (approuver/réserves/caution). Stockage localStorage + CRDT Yjs (D5.2 livré). Provider WebRTC pour sync multi-pairs à venir (D5.3).

h.
overlay inline à venir

Curation wiki / maintenance du graphe

Disponible en overlay inline à venir

Sur chaque fiche famille de la bibliothèque, un overlay vous laisse ajouter des notes de lecture, signaler une imprécision factuelle ou suggérer un enrichissement. Le travail des "gnomes" structurellement reconnu. Workflow B0 actuel : exporter ses contributions via /mes-contributions/ (signé DID) puis ouvrir un PR GitHub. Overlay éditable inline à venir.

Sur la gamification

Bactaegion ne distrait pas. Aucun classement, aucun XP, aucun streak. Aucune lootbox, aucune notification culpabilisante. La science n'a pas besoin d'être déguisée en casino pour devenir engageante.

Ce qu'on vise, c'est la satisfaction de Raph Koster : la reconnaissance d'un motif. Quand votre œil capte une répétition que l'algorithme avait classée comme bruit, votre cerveau libère sa propre dopamine — pas besoin qu'on vous fasse briller un badge. Notre travail consiste à dessiner les gestes pour que cette reconnaissance arrive vite, souvent, et sur des problèmes scientifiques réels.

L'attribution se fait par Open Badges 3.0 soulbound (W3C VC), non transférables, pontables sur ORCID. Une attestation atteste — elle ne classe pas. Un badge Annotateur de Schlafen est une description, pas un rang. Et le travail des "gnomes" qui corrigent les liens cassés compte autant que celui des "héros" qui posent une nouvelle piste.