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Pistes

Les hypothèses en cours d'examen par la communauté.

Chaque piste est une hypothèse scientifique falsifiable, signée par son auteur via DID, publiée en CC0. L'objectif n'est pas d'avoir raison du premier coup — c'est de proposer un raisonnement assez précis pour être réfuté empiriquement.

ébauche 18 mai 2026

Rétron mssDNA : le mécanisme leurre bactérien et sa résonance avec la restriction SAMHD1 des rétrovirus

Les rétrons bactériens produisent un ADN simple-brin modifié chimériquement (mssDNA) via leur transcriptase inverse (RT) endogène. Ce mssDNA agit comme leurre moléculaire ou senseur de l'infection phagique, déclenchant des systèmes effecteurs aval. La RT de rétron est phylogénétiquement ancestrale aux rétrotransposons eucaryotes (LINE-1) et aux rétrovirus. Comparer le mécanisme leurre mssDNA avec le mécanisme de restriction SAMHD1 (déplétion dNTP anti-rétrovirale) pour identifier des principes mécanistiques communs exploitables.

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ébauche 18 mai 2026

Druantia MotA : plateforme AAA⁺ de surveillance génomique et homologie avec les effecteurs antiviraux eucaryotes

Druantia encode MotA, une ATPase de la superfamille AAA⁺, qui surveille l'intégrité de la réplication ADN lors d'une infection phagique. Les ATPases AAA⁺ sont parmi les protéines les mieux conservées de l'évolution et incluent des acteurs antiviraux eucaryotes majeurs (VPS4 dans la voie ESCRT, RUVBL1/2 dans la réparation ADN, p97/VCP dans la dégradation protéique). Identifier si MotA constitue un template évolutif pertinent pour les inhibiteurs de ces cibles eucaryotes.

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ébauche 18 mai 2026

Lamassu : modèle bactérien pour l'épuisement sélectif des pools nucléotidiques dans la résistance antivirale

Lamassu est un système de défense anti-phage qui déplète des pools nucléotidiques spécifiques lors de l'infection, privant le phage de substrats essentiels à la réplication de son génome. En cartographiant la spécificité des NTPases de Lamassu et en la comparant à celle des antiviraux nucléotidiques approuvés (remdesivir, sofosbuvir), identifier si ce système peut orienter la conception de nouvelles sondes de perturbation du métabolisme nucléotidique viral.

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ébauche 18 mai 2026

Hachiman HamA/HamB : mécanisme de restriction antivirale à spectre large et parallèles dans l'immunité innée

Hachiman est un système anti-phage à deux composantes (HamA ATPase + HamB effecteur) caractérisé pour son activité antivirale à spectre particulièrement large. La diversité de phages ciblés suggère un mécanisme de reconnaissance conservé d'un groupe taxonomique phagique à l'autre — potentiellement un composant structural universel du cycle phagique. Identifier ce signal conservé et explorer des analogies avec des senseurs viraux innés eucaryotes.

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ébauche 18 mai 2026

ThsB Thoeris comme sonde structurale pour les voies NAD⁺-hydrolase antivirales (parallèle SARM1)

ThsB, le senseur TIR de Thoeris, hydrolyse le NAD⁺ en réponse à l'infection phagique — mécanisme identique à SARM1 humain, la seule NAD⁺-hydrolase à domaine TIR chez les vertébrés. Utiliser ThsB comme template évolutif pour identifier des modulateurs allostériques de SARM1 pertinents pour les défenses antivirales et la neuro-inflammation.

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ébauche 15 mai 2026

Modulateurs allostériques RdrB comme sondes de pharmacologie chimique pour ADAR1 (édition A→I host-directed)

Le complexe RADAR bactérien (RdrA ATPase + RdrB désaminase) édite l'ARN double-brin A→I, en homologie fonctionnelle directe avec ADAR1/ADAR2 humains. Identifier des modulateurs allostériques de RdrB par criblage in silico et tester leur transfert vers ADAR1 — la cible host-directed pour potentialiser la reconnaissance virale par MDA5.

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ébauche 15 mai 2026

Analogues stabilisés de cCMP et cUMP comme immunomodulateurs orthogonaux à l'axe cGAS-STING

Pycsar synthétise des signaux pyrimidiques cycliques (cCMP, cUMP) inconnus de l'immunité humaine. Concevoir des analogues stabilisés contre phosphodiestérases endogènes pour activer sélectivement les TLR/voies interféron sans toucher cGAS-STING — une seconde fenêtre d'immunomodulation jusqu'ici inexploitée.

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ébauche 15 mai 2026

Schlafen bactériennes comme template structural pour modulateurs SLFN11 humain (host-directed)

Les Schlafen bactériennes clivent les ARNt cellulaires pour bloquer la traduction des protéines virales (homologie fonctionnelle parfaite avec SLFN11 humain). Utiliser leur architecture catalytique compacte comme template pour cribler des modulateurs allostériques sélectifs de SLFN11, potentialisant l'action antivirale innée.

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ébauche 15 mai 2026

Énumération de prodrugs ddhCTP/ddhUTP comme terminateurs de chaîne RdRp de flavivirus

Les viperines bactériennes (Pfam Radical_SAM) convertissent CTP/UTP/GTP en analogues 3'-déshydro (ddhNTP) qui sont incorporés par les RdRp virales comme terminateurs de chaîne. Énumérer chimiquement les dérivés ddhNTP et leurs prodrugs pour franchir la membrane des cellules eucaryotes infectées par des flavivirus (Zika, Dengue, virus du Nil).

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Proposer une piste vous-même ?

Tu peux maintenant écrire ta propre hypothèse : crée ton identité DID sur /identite/ (WebAuthn — Touch ID, Windows Hello, clé FIDO2), branche ton moteur LLM via le BYOK Playground, formule ton hypothèse sourcée, puis convertis-la en draft MDX CC0 signé DID directement depuis l'atelier LLM. Le draft est téléchargeable et prêt à être soumis en PR sur le repo Bactaegion.

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