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Les systèmes de défense bactériens retenus pour la V1.

Cinq cibles thérapeutiques sélectionnées après audit cross-LLM des systèmes identifiés par GeneCLRDF (Pasteur 2026). Chacune ouvre une voie translationnelle distincte vers un antiviral humain ou animal.

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CBASS fort potentiel

CBASS Type II

Cyclic Oligonucleotide-Based Anti-Phage Signaling System. Une CD-NTase synthétise un second messager cyclique (souvent c-di-AMP ou cGAMP) en réponse à l'infection phagique, qui active un effecteur conduisant à la mort cellulaire abortive — coupure d'ADN, perforation de membrane, ou déplétion métabolique.

Modalité
Small molecules (analogues de nucléotides cycliques)
Parallèle
cGAS-STING
Princeps
Cohen et al. (2020)
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Pycsar fort potentiel

Pycsar

Pyrimidine Cyclase System for Antiphage Resistance. Une cyclase apparentée aux CD-NTases produit des signaux pyrimidiques cycliques (cCMP, cUMP) qui activent des effecteurs distincts de CBASS. Chimie souvent plus stable et moins polaire que les purines cycliques.

Modalité
Small molecules / analogues de pyrimidines cycliques
Parallèle
Voies TLR / interféron (par homologie fonctionnelle)
Princeps
Tal et al. (2021)
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RADAR fort potentiel

RADAR

Restriction by an Adenosine Deaminase Acting on RNA. Une ATPase (RdrA) et une désaminase (RdrB) forment des assemblages géants associés à l'édition A→I de l'ARN, conduisant à un arrêt antiviral. Conservation fonctionnelle remarquable avec ADAR1/ADAR2 eucaryotes.

Modalité
Small molecules host-directed (modulateurs de désaminases)
Parallèle
ADAR1 / ADAR2
Princeps
Duncan-Lowey et al. (2023)
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Schlafen fort potentiel

Schlafen bactériennes

Les protéines Schlafen bactériennes sont des ribonucléases qui clivent les ARNt cellulaires pour bloquer la synthèse protéique phagique. Homologie fonctionnelle parfaite avec SLFN11 humain qui restreint la réplication virale en ciblant les ARNt eucaryotes. Cible host-directed idéale.

Modalité
Modulateurs host-directed (contrôle du pool d'ARNt)
Parallèle
SLFN11 (humain)
Princeps
Perez Taboada et al. (2026)
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Viperin fort potentiel

Viperines bactériennes

Famille des viperines procaryotes. Une enzyme Radical-SAM convertit les nucléotides standards (CTP, UTP, GTP) en dérivés modifiés (ddhNTP) qui agissent comme terminateurs de chaîne contre l'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) des virus. La translation thérapeutique la plus immédiate de l'arsenal bactérien.

Modalité
Analogues nucléotidiques (small molecules)
Parallèle
RSAD2 (viperin humaine)
Princeps
Bernheim et al. (2021)
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