Cinq cibles thérapeutiques sélectionnées après audit cross-LLM des systèmes identifiés par GeneCLRDF (Pasteur 2026). Chacune ouvre une voie translationnelle distincte vers un antiviral humain ou animal.
Index Pagefind — toutes les pages publiées. ⌘K pour focus.
Famille hétérogène d'ATPases AAA+ couplées à des effecteurs variables (nucléases, peptidases, TIR). Profil druggable très favorable : poches ATP catalytiques bien définies, modulables par small molecules. Cinq sous-types (AVAST 1-5) avec activités distinctes.
Cyclic Oligonucleotide-Based Anti-Phage Signaling System. Une CD-NTase synthétise un second messager cyclique (souvent c-di-AMP ou cGAMP) en réponse à l'infection phagique, qui active un effecteur conduisant à la mort cellulaire abortive — coupure d'ADN, perforation de membrane, ou déplétion métabolique.
Pyrimidine Cyclase System for Antiphage Resistance. Une cyclase apparentée aux CD-NTases produit des signaux pyrimidiques cycliques (cCMP, cUMP) qui activent des effecteurs distincts de CBASS. Chimie souvent plus stable et moins polaire que les purines cycliques.
Restriction by an Adenosine Deaminase Acting on RNA. Une ATPase (RdrA) et une désaminase (RdrB) forment des assemblages géants associés à l'édition A→I de l'ARN, conduisant à un arrêt antiviral. Conservation fonctionnelle remarquable avec ADAR1/ADAR2 eucaryotes.
Famille à trois composants : ncRNA → RT → multicopy single-stranded DNA (msDNA) → effecteur toxique conditionnel. Les rétrons sont à la fois système de défense anti-phage ET outil d'édition génomique (RLR) largement étudié. Plateforme de biologie synthétique mature.
Les protéines Schlafen bactériennes sont des ribonucléases qui clivent les ARNt cellulaires pour bloquer la synthèse protéique phagique. Homologie fonctionnelle parfaite avec SLFN11 humain qui restreint la réplication virale en ciblant les ARNt eucaryotes. Cible host-directed idéale.
Système anti-phage à deux composants. Le senseur ThsB produit le second messager 3'-cADPR en réponse à l'infection. L'effecteur ThsA est une NADase activée par 3'-cADPR, qui dégrade le NAD+ cellulaire, conduisant à l'arrêt métabolique et la mort abortive. Mécanisme proche du TIR/SARM1 humain.
Famille des viperines procaryotes. Une enzyme Radical-SAM convertit les nucléotides standards (CTP, UTP, GTP) en dérivés modifiés (ddhNTP) qui agissent comme terminateurs de chaîne contre l'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) des virus. La translation thérapeutique la plus immédiate de l'arsenal bactérien.
Systèmes anti-phage portés par des reverse transcriptases bactériennes. Les sous-types DRT2/DRT3 utilisent un ARN non-codant (ncRNA) comme template pour synthétiser des séquences d'ADN spécifiques en réponse à l'infection. Première caractérisation structurale d'une polymérase d'acide nucléique anti-phage qui synthétise des répétitions di-nucléotidiques.
Système à cinq composants (DruA-E) découvert dans le screen pangénomique Sorek 2018. Mécanisme moléculaire encore partiel — détection de structures secondaires d'ADN viral suspectée. Présent dans ~2 % des génomes bactériens.
Système à 2 composants (HamA hélicase + HamB nucléase) qui détecte l'infection et dégrade l'ADN phagique. Présent dans ~3 % des génomes bactériens. Spectre d'activité anti-phage particulièrement large dans l'atlas Bernheim 2026.
Couple ATPase de la famille SMC (LmuA) + effecteur variable (LmuB). Détection des topologies inhabituelles d'acides nucléiques viraux, suivie de mort cellulaire abortive. Famille répandue dans l'atlas pangénomique mais mécanismes fins encore en investigation.
Couple récemment caractérisé (MkoA hélicase Superfamily 1 + MkoB module à activité variable). Distribution sporadique. Découverte 2024 → champ ouvert pour caractérisation mécanistique et exploration de pistes druggables sur le domaine hélicase.
Couple PtuA (ATPase) + PtuB (cytidine désaminase) qui détecte l'infection phagique et déclenche la mort cellulaire abortive. Mécanisme partiellement résolu, intérêt translationnel humain à ce stade indirect.
Couple KwaA + KwaB associé à la membrane bactérienne. Détecte vraisemblablement les perturbations membranaires causées par l'insertion phagique. Mécanisme moléculaire partiellement résolu, intérêt translationnel humain limité à ce stade.
Système de restriction basé sur la modification phosphorothioate (PT) de l'ADN. SspE est un effecteur GTPase qui reconnaît un motif 5'-CPSCA-3' modifié par PT, hydrolyse le GTP, et active sa nuclease HNH C-terminale pour cliver l'ADN phagique non-modifié. Mécanisme « recognize-hydrolyze-activate » avec interrupteur allostérique GTP.
Complexe à quatre sous-unités (JetA-D) qui détecte et clive spécifiquement l'ADN circulaire fermé (plasmides, ADN phagique). Mécanisme défensif anti-plasmide largement répandu mais pertinence virologique humaine limitée à ce stade.