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CABINET V4 · 1-26

Cette famille a un dossier dans le cabinet de la nouvelle expérience. La fiche V1 (cette page) reste la source longue ; le dossier v4 est plus visuel et orienté parcours.

Voir le dossier v4 →
Retron retenu V1

Retron

Famille à trois composants : ncRNA → RT → multicopy single-stranded DNA (msDNA) → effecteur toxique conditionnel. Les rétrons sont à la fois système de défense anti-phage ET outil d'édition génomique (RLR) largement étudié. Plateforme de biologie synthétique mature.

Origin story

Histoire de la découverte, ton vulgarisation. Voir aussi le petit lexique illustré.

Le système qui produit un ADN-leurre inutile en apparence, mais mortel pour le phage

caractérisé en 2022 · Bobonis, Mitosch, Mateus et al. (EMBL Heidelberg) pour le rôle anti-phage — mais la famille rétron est connue depuis Inouye et al. 1989

Les rétrons ont été découverts dans les années 1980 comme une curiosité bactérienne : des éléments génomiques qui produisent un ADN simple-brin chimériquement lié à un ARN (le mssDNA = multicopy single-stranded DNA), via leur propre reverse transcriptase. Pendant 30 ans, on n'a pas compris à quoi ça servait. Bobonis et al. (2022, Nature) ont fini par trouver : les rétrons forment un complexe toxine-antitoxine conditionnel où le mssDNA agit comme un "capteur" de l'état physiologique. En cas d'infection phagique, le mssDNA est altéré ou libéré, ce qui déclenche la toxine et tue la cellule (avorter l'infection). C'est de la défense par leurre + interrupteur — élégance maximale.

Pourquoi ça nous intéresse · RT de rétron = proxy biochimique pour LINE-1 humain (cible vieillissement, auto-immunité, neuro-inflammation). Tester les NRTI antirétroviraux approuvés (ténofovir, lamivudine) sur la RT de rétron pourrait révéler des candidats pour repositionner ces molécules en modulateurs LINE-1.

Stratégie V1

Modalité thérapeutique retenue

Sondes pharmacologiques pour RT eucaryotes + outils biotech

Opportunité in silico à 12 mois

Phylogénie RT bactérienne → LINE-1 humaine bien établie. Possibilité de cribler NRTI approuvés sur RT de rétron → repositionnement potentiel pour modulation LINE-1 (vieillissement, auto-immunité). Cf. hypothèse Bactaegion `retron-mssda-samhd1-link`.

Architecture moléculaire

Domaines senseurs

— non documentés en V1 —

Domaines effecteurs

Protéines

0 protéine associée dans Bactaegion. Noms et organismes fetchés en live depuis UniProt.

Aucune protéine annotée pour ce système en V1.

Littérature

Publications récentes (≥2018) mentionnant cette famille. Index OpenAlex, métadonnées CC0, fetché en live par votre navigateur.

Systèmes liés
df:DRT
Curation

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