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Bactaegion
cabinet / série 2026/2 / 1-14 · SspBCDE
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Mission collective Bactaegion○ local·0/ 478 206familles candidates touchées·0hypothèses thérapeutiques posées·0annotations menées à terme
Sources canoniques

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★ Sources curées
🔍 Recherche dans les bases publiques
Domaines protéiques
📚 Bibliographie de référence
Wang L. et al., Phosphorothioation of DNA in bacteria, Nat. Chem. Biol. 3 (2007).
Picton D.M. et al., SspE-mediated phosphorothioate defense, mBio 15 (2024).
★ Publication princeps
Zhou Y, Zhang K, He Y, Gao H, Zhong Y (2026). SspE-mediated immune defense: GTP hydrolysis as an allosteric switch coupling phosphorothioate recognition to DNA cleavage. mBio.
1-14 · piste claire · série 2026/2

SspBCDE

DNA phosphorothioate restriction

Le système qui change le squelette de son propre ADN pour ne pas se confondre avec l'ennemi

Famille Ssp — modifie le squelette de l'ADN bactérien (phosphorothioate, atome de soufre remplaçant un oxygène non-pontant) pour distinguer le soi du non-soi. Découverte chez Streptomyces lividans, élargie en 2024 (Picton et al., mBio).

Protéines
1
Hôte
bactéries
Découverte
Wang L., 2007
Mécanisme
soufre dans le squelette ADN
DOI piste
10.5281/zenodo.···
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✦ Le récit

Imagine que tu veuilles distinguer ton propre courrier de celui des spammeurs. Une bactérie a trouvé une solution radicale : modifier chimiquement la totalité de son propre ADN avec des groupes phosphorothioate (PT) — un atome de soufre à la place d'un oxygène dans la liaison phosphate. Ses propres protéines de défense (SspB, SspC, SspD) installent cette signature ; et SspE, l'effecteur GTPase à HNH nuclease, clive tout ADN qui ne porte PAS cette signature. Donc l'ADN phagique entrant, non-modifié, se fait découper. C'est de l'immunité par épigénétique — la bactérie marque le « soi » au sens chimique, et l'effecteur cible le « non-soi » par défaut. Une élégance algorithmique remarquable.

Découvert en 2007
Par Wang, Chen, Yang, Wei, Bao et al. (Shanghai Jiao Tong) — paper cryo-EM 2026 par Zhou et al. (mBio)
★ Pourquoi on s'en soucie

Pas d'orthologue humain direct, mais le paradigme « recognize-hydrolyze-activate » est transférable à d'autres GTPases régulées allostériquement (dynamines, septines). C'est aussi un magnifique outil de biologie synthétique : on peut ingénierer des bactéries à immunité PT-dépendante personnalisée.

◇ Le détail qui marque

Le cryo-EM 2026 (Zhou et al.) a montré que SspE forme un tétramère asymétrique où la reconnaissance du motif 5'-CPSCA-3' par un résidu Y63 déclenche une cascade : hydrolyse GTP (par R133), réarrangement allostérique, et libération du domaine HNH C-terminal pour cliver. Trois mutations (Y63A, R133A, N724A) abolissent chacune complètement la défense. Trois points de chute, donc trois sites d'inhibition potentiels.

Structure 3D · AlphaFold
SspE (Streptomyces) · A0A5J6IM44
ouvrir sur alphafold.ebi.ac.uk ↗fiche UniProt ↗
Modèle fetché en direct depuis AlphaFold-EBI · CC BY 4.0 · structure jamais stockée par Bactaegion
Sources
  1. Wang L. et al., Phosphorothioation of DNA in bacteria, Nat. Chem. Biol. 3 (2007).
  2. Picton D.M. et al., SspE-mediated phosphorothioate defense, mBio 15 (2024).
Pistes ouvertes sur SspBCDE · 1
SspE allostérique → trois sites druggables identifiés
en cours 3 contrib.